W kraterze Ngorongoro żyje około 25 000 dużych zwierząt. Odwiedzający często widzą lwy, słonie, bawoły, zebry, gnu i hieny. Krater jest również jednym z najlepszych miejsc w Tanzanii do obserwacji zagrożonego wyginięciem czarnego nosorożca. Hipopotamy gromadzą się w stałych zbiornikach wodnych, a flamingi często pojawiają się wzdłuż jeziora sodowego.