マハレには、少なくとも世界最大の保護個体群(約 700 ~ 1000 頭)のチンパンジー東部亜種が生息しています。
サイズ
この地域には少なくとも337種の鳥類が生息しており、その多くはアルバーティーン地溝帯に固有の希少種です。例えば、ペルズ・フィッシング・フクロウなど。
マハレの珍しい特徴の一つは、多様な生息地が共存していることです。この公園は、熱帯雨林、森林、竹林、山地林、山岳草原が重なり合うモザイク状の構造をしており、多様な生息地に依存する独特な動植物の共存を可能にしています。
マハレにはチンパンジーの他に、キイロヒヒ、ブルーモンキー、アカコロブス、シロコロブス、ベルベットモンキー、ガラゴの2~3種など、8種(おそらく9種)の霊長類が生息しています。
マハレの一部であるタンガニーカ湖は、長さ673km、幅60~80kmで、世界で2番目に長く、2番目に深い淡水湖です。
淡水
タンガニーカ湖の魚類相は、世界でも有数の多様性を誇ります。この湖には少なくとも400種の魚類が生息しており、そのうち約250種はシクリッドで、その98%は固有種(地球上の他の場所には生息していない種)です。